2023年南京医科大学录取新生5797人。其中，本科新生2745人占比47.35%，研究生3052人占比52.65%。本科生中男生1348人、女生1397人，男女比例大体相当；研究生中有男生1160人、女生1892人，女生占比达到了62%。

学校本科新生生源地中，江苏本地生源人数达到2172人，占本科新生总人数的79.13%。外省市录取本科生人数规模都不大，除新疆52人、福建51人、浙江44人、广西与贵州及湖南各41人、山东与四川各40人相对较多之外，其它地方录取人数则不太多了。10人以上的省市还有天津33人、安徽31人、上海27人、江西23人、陕西21人、重庆18人、北京与西藏各16人、广东与河南各11人、海南10人等。

学校的研究生生源来源中，江苏本科人数为1442人占比47.25%，占比接近一半。其它省市录取人数较多的有安徽455人、山东156人、浙江152人、河南114人、四川105人等人数在100人以上；另外30人以上则有湖南62人、山西57人、江西49人、福建48人、河北45人、陕西43人、湖北41人、重庆37人、广东31人、广西31人等较多。

从南京医科大学公布的各学院录取人数来看，本科生分布在学校的15个二级学院之中，其中第一临床医学院568人、第二临床医学院412人、第四临床医学院150人、口腔医学院130人、儿科学院100人、医学影像学院110人等比较受高考生及家长关注，因为所有能报考执业医师资格的本科专业大多分布在这些学院之中。

除上述二级学院之外，学校本科录取新生分布的学院，还有护理学院335人、公共卫生学院189人、药学院185人、医政学院135人、康复医学院121人、生物医学工程与信息学院105人、基础医学院75人、天元书院70人、外国语学院60人等。

研究生录取人数中，以第一临床医学院576人为最多。其次则是公共卫生学院392人、基础医学院247人、第四临床医学院214人等在200人以上。100人以上的学院有药学院148人、第二临床医学院128人、无锡医学中心128人、儿科学院124人、口腔医学院117人、第三临床医学院107人、姑苏学院105人、常州医学中心104人等。

录取的研究生分布在学校的31个学院（中心、实验室）中，除上述12个学院或中心录取人数在100人以上，另外50人以上的还有鼓楼临床医学院74人、生殖医学与子代健康全国重点实验室72人、护理学院和医政学院各69人、附属淮安第一医院61人、医学影像学院5652人、泰州临床医学院50人等。其余则有金陵临床医学院37人、逸夫医院34人、康复医学院25人、连云港临床医学院24人等在20人以上，其它全部在15人以下，甚至大部分只有5人以下。

南京医科大学录取的本科新生中，有96.5%的学生出生于2004-2005年，年龄非常集中。而研究生则大都出生于1999-2001年，这三个年份的学生人数占比达到74.6%。